Apunavigaatio
Mykobakteeridiagnostiikka
Mykobakteeridiagnostiikka
-
M. tuberculosis complex -lajimääritys ja atyyppisten mykobakteerien lajimääritys tehdään Geno Type - liuskahybridisaatiotestillä (Hain Life Science). Tarvittaessa tunnistusta jatketaan 16 S rDNA-sekvensoinnilla.
M. tuberculosis- lääkeherkkyysmääritys tehdään viljelyautomaatilla nestemäisessä elatusaineessa. Käytetyt lääkeaineet ovat isoniatsidi, rifampisiini, streptomysiini, etambutoli, ja pyratsiiniamidi.
TB-herkkyysmääritys tehdään maksuttomana referenssitoimintona.Resistentin M. tuberculosis –kannan lääkeherkkyysmääritykset tehdään suppean alueen MIC-määrityksenä 7H10-agarilla. Määritys tehdään vain kannoille, joiden epäillään tai tiedetään olevan resistenttejä yhdelle tai useammalle peruslääkkeelle. Käytetyt lääkeaineet ovat sykloseriini, etionamidi, p-aminosalisyylihappo, amikasiini ja ofloksasiini.
Rifampisiini- ja isoniatsidi-pikamääritys tehdään M. tuberculosis –kannoille, joiden epäillään olevan moniresistenttejä (MDR-TB). Määritys tehdään sekvensoimalla rpo B-geenistä tai katG-geenistä resistenssiä aiheuttavia mutaatioita sisältävä alue.
M. avium complex (MAC) lääkeherkkyysmääritys tehdään suppean alueen MIC-määrityksenä atsitromysiinille, klaritromysiinille, etambutolille, klofatsimiinille ja rifabutiinille.
M. chelonae- fortuitum- kompleksin lääkeherkkyys testataan E-testillä amikasiinille, doksisykliinille, imipeneemille, kefoksitiinille, klaritromysiinille, siprofloksasiinille, sulfmetoksiatsolille ja tobramysiinille.
Muut atyyppiset mykobakteerit testataan maljamenetelmällä seuraaville lääkeaineille: isoniatsidi, rifampisiini, streptomysiini, etambutoli, pyratsiiniamidi, amikasiini, siprofloksasiini ja levofloksasiini.
M. tuberculosis genotyypitys tehdään MIRU-VNTR ja spoligotyypitys-menetelmillä M. tuberculosis –kannoista pyydettäessä. Näillä menetelmillä selvitetään tiettyjen kantojen yhteenkuuluvuutta esimerkiksi epäiltäessä laboratoriokontaminaatiota.
M.tuberculosis genotyypitys
Tilastot
Mykobakteerit 2002-2006
MTB-lääkeherkkyys 2002-2006