Publisher

National Public Health Institute

RNA-virusten lisääntyessä niiden genomiin kertyy yhden emäksen kopiointivirheitä eli pistemutaatioita. Kahden sukulaisviruksen lisääntyessä samassa isäntäsolussa osalla jälkeläisistä on mosaiikkigenomi, osia molemmista "vanhemmista". Tätä ilmiötä sanotaan rekombinaatioksi. Pistemutaatioiden ja rekombinaatioiden seurauksena RNA-virusten normaali olomuoto on geneettisten mikromuunnosten seos, minkä seurauksena niiden kyky sopeutua uusiin olosuhteisiin on erittäin suuri. Viruksen sopeutuessa uusiin olosuhteisiin joku tai jotkut muunnoksista rikastuvat ympäristön valintapaineessa tai valikoituvat sattuman seurauksena.

Enteroviruslaboratorio otti ensimmäisenä Suomessa käyttöön viruskantojen sekvenssianalyysin epidemiaselvityksessä. Polion valvonnasta tämä lähestymistapa on sittemmin ulotettu muihin enteroviruksiin ja rinoviruksiin. Sekvenssianalyysien avulla pyrimme myös ymmärtämään evoluution lainalaisuuksia, lajien ja serotyyppien syntyhistoriaa sekä viruskantojen fenotyyppisten ominaisuuksien (ilmiasun) geneettistä määräytymistä.

Julkaisut

Smura T, Blomqvist S, Paananen A, Vuorinen T, Sobotová Z, Bubovika V, Ivanova O, Hovi T, Roivainen M. Enterovirus surveillance reveals proposed new serotypes and provides new insight into enterovirus 5’-untranslated region evolution. J Gen Virol 88: 2520-2526, 2007.

Smura T, Junttila N, Blomqvist S, Norder H, Paananen A, Magnius L, Hovi T, Roivainen M. Enterovirus 94, a proposed new serotype in human enterovirus species D. J Gen Virol, 88:849-58, 2007.

Laine P, Savolainen C, Blomqvist S, Hovi T. Phylogenetic analysis of human rhinovirus capsid protein VP1 and 2A protease coding sequences confirms shared genus-like relationships with human enteroviruses. J Gen Virol. 86:697-706, 2005.

Savolainen C, Laine P, Mulders MN, Hovi T. Sequence analysis of human rhinoviruses in the RNA-dependent RNA polymerase coding region reveals large within-species variation. J Gen Virol. 85:2271-7, 2004.

Blomqvist S, Savolainen C, Råman L, Roivainen M, Hovi T. Human rhinovirus 87 and enterovirus 68 represent a unique serotype with rhinovirus and enterovirus features. J Clin Microbiol 40:4218-4233, 2002

Savolainen C, Blomqvist S, Mulders M, Hovi T. Genetic clustering of all 102 human rhinovirus prototype strains - serotype 87 is close to human enterovirus 70. J Gen Virol 83:333-340, 2002

Savolainen C, Mulders MN, Hovi T. Phylogenetic analyses of rhinovirus isolates collected during successive epidemic seasons. Vir Res.85:41-46, 2002.

Savolainen C, Hovi T, Mulders MN. Molecular epidemiology of echovirus 30 in Europe: succession of dominant sublineages within a single major genotype. Arch Virol 146:521-537, 2001

Mulders MN, Salminen M, Kalkkinen N, Hovi T. Molecular epidemiology of coxsackievirus B4 and disclosure of the correct VP1/2A(pro) cleavage site: evidence for high genomic diversity and long-term endemicity of distinct genotypes. J Gen Virol 81:803-812, 2000.